Ich sehe durchaus universelle "Nebenprodukte" der Aufklärung (Beispiel Menschenrechte etc.), die man getrost verallgemeinern kann. Die Ideen als solche wären ebenso verallgemeinerbar.
In Bezug auf den Islam aber, stellen sich andere Thematiken:
Wenn man davon spricht, im Islam habe keine Aufklärung stattgefunden (was ja auch so ist), will man wohl in erster Linie darauf hinaus, dass sich Politik und Religion hier eng vermischen. Das liegt wohl in erster Linie an der Geschichte, der Islam war eine sehr früh sehr siegreiche Religion (das Christentum in seinen Anfängen unterdrückt und verfolgt). Hier setzen komplett andere Denkstrukturen ein. Ein aufgrund seiner Religion Verfolgter trennt sehr einfach zwischen Staat und Kirche. Im Islam ist das (zumindest in den Ansätzen) dasselbe. Es ist kein Zufall, dass ein Großteil der Länder die eine hochoffizielle Staatsreligion besitzen islamisch sind (meines Wissens 2x katholisch, 1x hinduistisch, 2x buddhistisch und ca. 20x islamisch)
Wenngleich der Islam übrigens nicht unbeteiligt war an der Aufklärung (die auf griechischen Philosophen basiert, die vom Islam wiederum vor dem damaligen christlichen Vernichtungssturm gerettet wurden), lässt sich nicht einfach die Aufklärung als Ideologie überstülpen (auch wenn die Idee noch so gut und schön ist): In diesem Sinne ist die Aufklärung eine zutiefst europäisch-christliche Idee, die der hiesigen Tradition entspringt. Es müsste, wenn, dann eine "islamische Aufklärung" stattfinden. Nur stellt sich auch die Frage, ob das nötig ist, zumal sich die Aussage, es habe keine Aufklärung stattgefunden, sich allzu oft auf Islamismus und Fundamentalismus bezieht (und ich nenne das Ideologien und keineswegs Religion).
Wohin Aufklärung, oder besser der Versuch einer Reform gehen kann, sieht man dann am Beispiel des Iran: Analog zu Atatürks Türkei wollte dort Reza Schah das Land "reformieren". Und während das in der Türkei mehr oder weniger gelungen ist, endet es im Iran in einer Katastrophe: Mit Gewalt und Unterdrückung gegen den Willen des Volks wurde versucht zwanghaft etwas überzustülpen. Damit bringt Reza Schah dann die Kleriker endgültig gegen sich auf. Das Ergebnis ist letztlich heute deutlich sichtbar.